熱科院全球首次完成并公布海南高種椰子全基因組測(cè)序

　　原標(biāo)題：熱科院全球首次完成并公布椰子全基因組測(cè)序

　　多國(guó)研究單位希望深度合作

　　?？诰W(wǎng)11月2日消息（記者龍易強(qiáng)?通訊員鄔慧彧）近日，記者從中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院了解到，由熱科院椰子研究所、熱帶生物技術(shù)研究所、華大基因和法國(guó)農(nóng)業(yè)國(guó)際合作研究中心（CIRAD）等單位共同完成了椰子（Cocos?nucifera?L）的基因組測(cè)序拼接及序列分析工作，海南高種椰子全基因組測(cè)序的完成及公布尚屬全球首次。

　　據(jù)了解，該項(xiàng)研究是在省科技廳國(guó)際合作專項(xiàng)、科技重大專項(xiàng)和熱科院基本業(yè)務(wù)費(fèi)的支持下，由熱科院椰子研究所主導(dǎo)完成，并于10月5日在線發(fā)表在《大數(shù)據(jù)科學(xué)》（GigaScience）雜志上。該研究完成了對(duì)椰子的基因組序列拼接，生成了大小為2.20Gb的椰子基因組草圖，基因組覆蓋度90.91%（2.42Gb）。作為椰子的藍(lán)圖，整個(gè)基因組存在28039蛋白質(zhì)編碼基因，歸屬于14411個(gè)基因家族，其中有282個(gè)家族是椰子特有的，這些信息為椰子功能基因組的研究提供了很好的基礎(chǔ)。目前圍繞基因組序列數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，一個(gè)高密度的遺傳圖譜及更精細(xì)的椰子基因組圖譜正在構(gòu)建中，棕櫚染色體的演化及椰子耐鹽的特性的組學(xué)分析工作也將于近期完成。

　　椰子全基因組公布的同時(shí)也開(kāi)啟了椰子的后基因組時(shí)代，海南高種椰子作為一個(gè)參考基因組，將為椰子個(gè)體的重測(cè)序、功能基因的挖掘（高抗，優(yōu)質(zhì)相關(guān)）及抗逆分子機(jī)理（低溫、高鹽、干旱等）和重要品種形成機(jī)理的研究（香味、顏色等）、DNA分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)、椰子重要農(nóng)藝性狀的解析和關(guān)聯(lián)分析、全基因組關(guān)聯(lián)分析等提供參考體系，同時(shí)也為國(guó)內(nèi)外椰子科技的合作提供紐帶，抗寒、耐旱、耐鹽、高油基因組的挖掘與利用有可能推動(dòng)椰子產(chǎn)業(yè)取得飛躍性進(jìn)展。

　　“這是椰子所占據(jù)全球椰子研究制高點(diǎn)的關(guān)鍵一步，是全球椰子科技里程碑性的事件，對(duì)于擴(kuò)大中國(guó)在全球的科技影響意義巨大，同時(shí)將極大地促進(jìn)椰子遺傳育種的研究與應(yīng)用。”熱科院一位專家介紹道，目前該信息已經(jīng)引起椰子科技界的轟動(dòng)，法國(guó)、澳大利亞、斯里蘭卡、印度等國(guó)家的研究單位已向熱科院提出進(jìn)一步深度合作的希望。

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