記者2日從中國熱帶農業科學院獲悉,該院椰子研究所近日首次公開在《大數據科學》(《GigaScience》)雜志上發表了海南高種椰子的全基因組測序。
據了解,此前,對椰子的全基因組測序研究在行業內是一片空白。從2013年開始,中國熱科院椰子研究所聯合熱帶生物技術研究所、華大基因和法國農業國際合作研究中心(CIRAD)自籌經費展開研究,于2015年首次完成椰子的基因組序列拼接,成功發現椰子擁有282個特有基因家族,這些信息為椰子功能基因組的研究奠定了良好基礎。
科學家根據全基因組測序研究,便可從基礎原理解釋:椰子為什么生長在海邊?為什么椰子的油含量很高,并且富含水分?為什么有的椰子3年開花,有的8年開花?
該研究團隊專家介紹,海南高種椰子基因組能為椰子以及棕櫚科作物耐鹽、抗旱、抗寒、高油等功能基因的挖掘提供參考,也可以解釋椰子高油、耐鹽、抗風等原理,對椰子重要農藝性狀的解析及全基因組關聯分析提供參考體系。“全基因組測序工作的完成,好比繪制了一張椰子基因地圖,科學家可按圖索驥,培育更高產、耐旱、抗病的優質新品種,育種周期將大大縮短,改變椰子新品種單一的現象。”
據悉,椰子作為重要的熱帶水果以及油料作物,當地許多民眾直接或間接從業椰子產業,對海南地方經濟和社會的發展起著非常重要作用。
研究團隊專家表示,目前圍繞基因組序列數據基礎,一個高密度的遺傳圖譜及更精細的椰子基因組圖譜正在構建中,棕櫚染色體的演化及椰子耐鹽的特性的組學分析工作也將于近期完成。
目前,來自法國、澳大利亞、斯里蘭卡、印度等國的椰子研究單位已向中國熱帶農業科學院表達深度合作意向。(完)
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熱科院全球首次完成并公布海南高種椰子全基因組測序?
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