????1987年，中國南沙綜合科考隊登陸半月礁，留下了中國石碑和標識物。1995年3月， 菲律賓軍隊破壞中國美濟礁北部的五方礁、南部的半月礁上的中國石碑和標識物。菲律賓國防部宣布向美濟礁及附近島礁增兵，并在半月礁上設立了一些標識和避難所。對此，中國外交部發言人回應，半月礁在中方控制范圍之內。

????菲律賓法律嚴禁捕撈海龜，當地也無食用海龜的習俗；而中醫中把海龜殼列為珍貴藥材，具有極高經濟價值。故海龜捕撈經常成為中菲圍繞南海爭議島礁糾紛的引爆點。2010年，菲海岸警衛隊在半月礁附近海域扣押9名中國漁民，在船上搜出一些漁網和據稱用來制作海龜標本的材料以及福爾馬林等藥品，菲海警指控這些漁民涉嫌偷獵海龜。

????2012年7月11日，解放軍海軍1艘護衛艦在南沙半月礁附近海域執行例行巡邏任務時意外擱淺，令菲方大為緊張，菲派遣軍方人員調查是否屬于意外事故。7月15日，護衛艦在救援兵力協助下自主脫淺成功，艦艇艏部輕度受損，人員安全。